RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552301.1

PRPF40B-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF40B, Length 912 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40B-216ENST00000552301 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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PRPF40B-216ENST00000552301 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PRPF40B-216ENST00000552301 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PRPF40B-216ENST00000552301 BCL11AQ9H165 835 aa22.67■■□□□ 1.22
PRPF40B-216ENST00000552301 VEZTQ9HBM0 779 aa22.67■■□□□ 1.22
PRPF40B-216ENST00000552301 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.67■■□□□ 1.22
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PRPF40B-216ENST00000552301 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PRPF40B-216ENST00000552301 SPATA5Q8NB90 893 aa22.66■■□□□ 1.22
PRPF40B-216ENST00000552301 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PRPF40B-216ENST00000552301 CDCA5Q96FF9 252 aa22.66■■□□□ 1.22
PRPF40B-216ENST00000552301 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PRPF40B-216ENST00000552301 ABCF2Q9UG63 623 aa22.66■■□□□ 1.22
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PRPF40B-216ENST00000552301 DLK2Q6UY11 383 aa22.64■■□□□ 1.21
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PRPF40B-216ENST00000552301 KLRG1Q96E93 195 aa22.64■■□□□ 1.21
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PRPF40B-216ENST00000552301 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.63■■□□□ 1.21
PRPF40B-216ENST00000552301 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PRPF40B-216ENST00000552301 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.63■■□□□ 1.21
PRPF40B-216ENST00000552301 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.63■■□□□ 1.21
PRPF40B-216ENST00000552301 MRIQ9BWK5 157 aa22.63■■□□□ 1.21
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PRPF40B-216ENST00000552301 PI16Q6UXB8 463 aa22.62■■□□□ 1.21
PRPF40B-216ENST00000552301 SLF2Q8IX21 1173 aa22.62■■□□□ 1.21
PRPF40B-216ENST00000552301 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.62■■□□□ 1.21
PRPF40B-216ENST00000552301 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.62■■□□□ 1.21
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PRPF40B-216ENST00000552301 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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PRPF40B-216ENST00000552301 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.52■■□□□ 1.2
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