RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.74□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 CPA4Q9UI42 421 aa8.74□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 DLL1O00548 723 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 IRF6O14896 467 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC4A2P04920 1241 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 RALBP1Q15311 655 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 KAZALD1Q96I82 304 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 GABRQQ9UN88 632 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNA4P22459 653 aa8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 INPP5BP32019 993 aa8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 GNAI1P63096 354 aa8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 C17orf99Q6UX52 265 aa8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CTDSP2-208ENST00000552294 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 TLR2O60603 784 aa8.71□□□□□ -1.02
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CTDSP2-208ENST00000552294 CRKP46108 304 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNJ4P48050 445 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MAP3K9P80192 1104 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 Q7L0L9 218 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.71□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MYH3P11055 1940 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CCL5P13501 91 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 FLIIQ13045 1269 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 BEND3Q5T5X7 828 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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CTDSP2-208ENST00000552294 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 DPF3Q92784 378 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 STAP2Q9UGK3 403 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CYP2C8P10632 490 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ELNP15502 786 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 PSMC4P43686 418 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 GTF2A2P52657 109 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 PRKCZQ05513 592 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 LRRC24Q50LG9 513 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 PEX10O60683 326 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 NFIAQ12857 509 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIM32Q13049 653 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 SUCLG2Q96I99 432 aa8.68□□□□□ -1.02
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CTDSP2-208ENST00000552294 SRRDQ9UH36 339 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 UNCXA6NJT0 531 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 PDHXO00330 501 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 VAMP4O75379 141 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 GJA8P48165 433 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 BCAMP50895 628 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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