RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550722.5

HECTD4-211, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HECTD4, Length 15,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-211ENST00000550722 RARSP54136 660 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.97□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 KANK3Q6NY19 840 aa6.97□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 PAX7P23759 505 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 ATP2B2Q01814 1243 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 IFT81Q8WYA0 676 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 SGSM3Q96HU1 749 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 C8orf76Q96K31 380 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 IWS1Q96ST2 819 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 PSMC4P43686 418 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.96□□□□□ -1.29
HECTD4-211ENST00000550722 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC151A5D8V7 595 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 SKIP12755 728 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CLCN6P51797 869 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 STAMBPO95630 424 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 POLE2P56282 527 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 SYT1P21579 422 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 SKAP1Q86WV1 359 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 NBPF15Q8N660 670 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PTPRCP08575 1304 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 KDM1AO60341 852 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 MSL3P1P0C860 447 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.96□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 TUBA1BP68363 451 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 TUBA1AQ71U36 451 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ATICP31939 592 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 RPS6KA3P51812 740 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CABP4P57796 275 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC184Q52MB2 194 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 OGFOD1Q8N543 542 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 EPSTI1Q96J88 318 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 IQCDQ96DY2 449 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 TYRO3Q06418 890 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 C21orf2O43822 256 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 UBE4AQ14139 1066 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ZNF280DQ6N043 979 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PRC1O43663 620 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ZNF76P36508 570 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 NFE2L2Q16236 605 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC102BQ68D86 513 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ZMYM3Q14202 1370 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PAX3P23760 479 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 LMNB2Q03252 620 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 SCP2P22307 547 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CATSPER2Q96P56 530 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 PALMDQ9NP74 551 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.95□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 IFT88Q13099 833 aa6.94□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.94□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.94□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 RPS6KA5O75582 802 aa6.94□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 ZNF131P52739 623 aa6.94□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 TMEM232C9JQI7 657 aa6.94□□□□□ -1.3
HECTD4-211ENST00000550722 TMC6Q7Z403 805 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms