RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.96	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	TJP1	Q07157	1748 aa		13.95	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	GJB2	P29033	226 aa		13.95	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CTSW	P56202	376 aa		13.95	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.95	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.95	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.95	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CA12	O43570	354 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CAVIN2	O95810	425 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	MCM5	P33992	734 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	EPHX2	P34913	555 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	EVC	P57679	992 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT85	P78386	507 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	DGKZ	Q13574	1117 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	PKP1	Q13835	747 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	APPBP2	Q92624	585 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	PDE6B	P35913	854 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	NT5C2	P49902	561 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ME3	Q16798	604 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	LPIN2	Q92539	896 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	GOLIM4	O00461	696 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	PFKFB2	O60825	505 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	PDE8B	O95263	885 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	TIMM10	P62072	90 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ITGA6	P23229	1130 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	MAP2K2	P36507	400 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	FGD1	P98174	961 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP21A2	P08686	494 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	ALX1	Q15699	326 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	CNKSR1	Q969H4	720 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	SLX4	Q8IY92	1834 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-223	ENST00000550442	GNAT2	P19087	354 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	POTED	Q86YR6	584 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC5A1	P13866	664 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	CLCN1	P35523	988 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	SOX10	P56693	466 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	TRDN	Q13061	729 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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