RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548896.1

HECTD4-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 4

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-208	ENST00000548896	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HECTD4-208	ENST00000548896	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	SERTM1	A2A2V5	107 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	EML1	O00423	815 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	BMP4	P12644	408 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	TESK2	Q96S53	571 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	OIP5	O43482	229 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	TNP2	Q05952	138 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	PEAK1	Q9H792	1746 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	UTRN	P46939	3433 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	SEC13	P55735	322 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	PTK7	Q13308	1070 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	HCN2	Q9UL51	889 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	RASSF7	Q02833	373 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	USP6	P35125	1406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	CCDC7	Q96M83	1385 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	SLIT3	O75094	1523 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	EXOC5	O00471	708 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	C21orf2	O43822	256 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM157B	P0CG42	384 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	SLC15A2	Q16348	729 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HECTD4-208	ENST00000548896	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM196B	A6NMK8	535 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896		E9PSI1	815 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	IRS1	P35568	1242 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	DPYD	Q12882	1025 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	GDF11	O95390	407 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	CD33	P20138	364 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L10	C9JJH3	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L21	D6R901	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HECTD4-208	ENST00000548896	ARAF	P10398	606 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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