RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 TTC28Q96AY4 2481 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 CSF1RP07333 972 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 CSRNP1Q96S65 589 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 NEFLP07196 543 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 CCDC102BQ68D86 513 aa9.29□□□□□ -0.92
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CS-212ENST00000548567 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 RASGRF1Q13972 1273 aa9.28□□□□□ -0.92
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CS-212ENST00000548567 GDF11O95390 407 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-212ENST00000548567 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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CS-212ENST00000548567 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CPA4Q9UI42 421 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 ALDH1L1O75891 902 aa9.27□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 TEKT1Q969V4 418 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 ECE1P42892 770 aa9.26□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.26□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 OPTNQ96CV9 577 aa9.25□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 RNF186Q9NXI6 227 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.25□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.25□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 CNTNAP1P78357 1384 aa9.24□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 BTDP43251 543 aa9.24□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 CSADQ9Y600 493 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
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CS-212ENST00000548567 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.938e-7■■□□□ 12.3
CS-212ENST00000548567 PRDM1O75626 825 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-212ENST00000548567 GNAI3P08754 354 aa9.23□□□□□ -0.93
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