RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 BECN1Q14457 450 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 DCAF15Q66K64 600 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PICK1Q9NRD5 415 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 MTMR7Q9Y216 660 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 C5P01031 1676 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 PDE4AP27815 886 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TEX11Q8IYF3 940 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 USP40Q9NVE5 1235 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TDO2P48775 406 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 FOXO4P98177 505 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CABP5Q9NP86 173 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ANAPC15P60006 121 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CSF1RP07333 972 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RLBP1P12271 317 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SCARF1Q14162 830 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC102BQ68D86 513 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 GCC1Q96CN9 775 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 COPRSQ9NQ92 184 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CIAO1O76071 339 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 KCNA3P22001 575 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 PHKA1P46020 1223 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TNNI3KQ59H18 835 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CEP85Q6P2H3 762 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 C1QTNF8P60827 252 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 NFKBIBQ15653 356 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TICAM2Q86XR7 235 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SPATA5Q8NB90 893 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SBF2Q86WG5 1849 aa6.57□□□□□ -1.36
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PTPRB-206ENST00000548122 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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PTPRB-206ENST00000548122 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MXD3Q9BW11 206 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SEMA3EO15041 775 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 APLP1P51693 650 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 DPF2Q92785 391 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CRKP46108 304 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ADORA1P30542 326 aa6.56□□□□□ -1.36
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PTPRB-206ENST00000548122 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MED23Q9ULK4 1368 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TRDNQ13061 729 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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