RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNA1SQ13698 1873 aa23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 BBOX1O75936 387 aa23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 XDHP47989 1333 aa23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 LTBP1Q14766 1721 aa23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXP2O15409 715 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 F13A1P00488 732 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE6AP16499 860 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF445P59923 1031 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE3CQ15386 1083 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 PDCP20941 246 aa23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 Q6ZUG5 572 aa23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS37DQ86XT2 251 aa23.97■■□□□ 1.43
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PACSIN3-211ENST00000539589 MTMR6Q9Y217 621 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-211ENST00000539589 NPR1P16066 1061 aa23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE6BP35913 854 aa23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 FGD1P98174 961 aa23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
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PACSIN3-211ENST00000539589 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMA4Q16363 1823 aa23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0G2JLW4 131 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 GPAA1O43292 621 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 USP48Q86UV5 1035 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP3K12Q12852 859 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 PANK2Q9BZ23 570 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 E7EWF7 191 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 STK3Q13188 491 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 SP8Q8IXZ3 490 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF3C6Q969F1 213 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 SEMA3EO15041 775 aa23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 OLFM4Q6UX06 510 aa23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 POLLQ9UGP5 575 aa23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 UFL1O94874 794 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 BRF1Q92994 677 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 MASTLQ96GX5 879 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.91■■□□□ 1.42
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PACSIN3-211ENST00000539589 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP2B4P23634 1241 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 GGA1Q9UJY5 639 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.91■■□□□ 1.42
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB22O15209 634 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF384Q8TF68 577 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 SLX4Q8IY92 1834 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 DTNBO60941 627 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 TMC4Q7Z404 712 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC125Q86Z20 511 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-211ENST00000539589 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 ALDH1B1P30837 517 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 JAG2Q9Y219 1238 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 CHD4Q14839 1912 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.89■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 FGAP02671 866 aa23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 PFKFB2O60825 505 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 CHRNA5P30532 468 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 RAI14Q9P0K7 980 aa23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 MBD4O95243 580 aa23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2HP62256 183 aa23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 AIDAQ96BJ3 306 aa23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3-211ENST00000539589 ARMT1Q9H993 441 aa23.86■■□□□ 1.41
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