RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-208	ENST00000537120	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	SREBF2	Q12772	1141 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	LPIN2	Q92539	896 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	TBC1D8	O95759	1140 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	GNAI3	P08754	354 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	TEKT1	Q969V4	418 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	TM4SF4	P48230	202 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	INHBE	P58166	350 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	ATP2B3	Q16720	1220 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	MIER1	Q8N108	512 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	FBXO3	Q9UK99	471 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	MAST3	O60307	1309 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	CIAO1	O76071	339 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	SRGAP3	O43295	1099 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	ALDH1A1	P00352	501 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	FGFR2	P21802	821 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	GRIK5	Q16478	980 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	MEIS3	Q99687	375 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	MRI	Q9BWK5	157 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
DDB1-208	ENST00000537120	AOX1	Q06278	1338 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	BCAR3	O75815	825 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	GNAI2	P04899	355 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	CACNB3	P54284	484 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	10.39	□□□□□ -0.75	1e-8	■■■□□ 15.9
DDB1-208	ENST00000537120	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	WNK4	Q96J92	1243 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	ELP3	Q9H9T3	547 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	CSAD	Q9Y600	493 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120		A0A1B0GUL6	1792 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	GPR25	O00155	361 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	FKTN	O75072	461 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	TIMM10	P62072	90 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.38	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	SEMA3E	O15041	775 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	PHKA1	P46020	1223 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	TFCP2	Q12800	502 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	IFNL1	Q8IU54	200 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.37	□□□□□ -0.75
DDB1-208	ENST00000537120	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.37	□□□□□ -0.75

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