RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 MRIQ9BWK5 157 aa26.97■■□□□ 1.91
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PTPRK-222ENST00000532751 CST9Q5W186 159 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.96■■□□□ 1.91
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PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.95■■□□□ 1.9
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PTPRK-222ENST00000532751 AACSQ86V21 672 aa26.93■■□□□ 1.9
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PTPRK-222ENST00000532751 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.91■■□□□ 1.9
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PTPRK-222ENST00000532751 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRK-222ENST00000532751 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.9■■□□□ 1.9
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PTPRK-222ENST00000532751 ECE1P42892 770 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRK-222ENST00000532751 HUNKP57058 714 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRK-222ENST00000532751 RAI14Q9P0K7 980 aa26.84■■□□□ 1.89
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PTPRK-222ENST00000532751 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 CAPNS2Q96L46 248 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 CYP4F22Q6NT55 531 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.79■■□□□ 1.88
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