RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 APBB1O00213 710 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 CRKP46108 304 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 AACSQ86V21 672 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 DOCK2Q92608 1830 aa23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 PRDX5P30044 214 aa23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 MCAMP43121 646 aa23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 MYO1BO43795 1136 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 AAMPQ13685 434 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA5Q8NB90 893 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 TEKT1Q969V4 418 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 MRIQ9BWK5 157 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP350Q5VT06 3117 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 PI16Q6UXB8 463 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 DLK2Q6UY11 383 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 DCTPP1Q9H773 170 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 AOX1Q06278 1338 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 CST9Q5W186 159 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCF2Q9UG63 623 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 CDCA5Q96FF9 252 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 CLRN2A0PK11 232 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 MYH7P12883 1935 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 AK9Q5TCS8 1911 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 VEZTQ9HBM0 779 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 SNRKQ9NRH2 765 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-208ENST00000531226 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 CNTNAP1P78357 1384 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 ZAP70P43403 619 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFAIP1Q13829 316 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 KLRG1Q96E93 195 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 BCL11AQ9H165 835 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 RASSF10A6NK89 507 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 SLF2Q8IX21 1173 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 GAKO14976 1311 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 MECOMQ03112 1051 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 FOCADQ5VW36 1801 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF384Q8TF68 577 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 RAI14Q9P0K7 980 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 IGSF3O75054 1194 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 NF2P35240 595 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 OTOFQ9HC10 1997 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-208ENST00000531226 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-208ENST00000531226 TNNI2P48788 182 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-208ENST00000531226 CACNB3P54284 484 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-208ENST00000531226 GSTO1P78417 241 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-208ENST00000531226 RASA3Q14644 834 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-208ENST00000531226 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-208ENST00000531226 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.2■■□□□ 1.3
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