RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ABCB6Q9NP58 842 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ADAM23O75077 832 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ATP2B2Q01814 1243 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 USP26Q9BXU7 913 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF576Q9H609 170 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ITPKAP23677 461 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 CEP41Q9BYV8 373 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZS46 218 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 FBF1Q8TES7 1133 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 BCO2Q9BYV7 579 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 RNF208Q9H0X6 261 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 DYRK3O43781 588 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 FCGRTP55899 365 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 SETDB2Q96T68 719 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 B3GALT4O96024 378 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 E9PSI1 815 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 FDX2Q6P4F2 183 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 SOGA1O94964 1423 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 CYP11A1P05108 521 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 SPG7Q9UQ90 795 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 MAOBP27338 520 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 POU4F3Q15319 338 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 CORO1BQ9BR76 489 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
PTPRC-214ENST00000530727 FAAP100Q0VG06 881 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 UVSSAQ2YD98 709 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 EEA1Q15075 1411 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 TOPBP1Q92547 1522 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 MEGF11A6BM72 1044 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 DLGAP3O95886 979 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC27Q2M243 656 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 GIPC1O14908 333 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 GSTT1P30711 240 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 PREPP48147 710 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 AP3B2Q13367 1082 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 COL19A1Q14993 1142 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-214ENST00000530727 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms