RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.83□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 GATA4P43694 442 aa6.83□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 DOC2BQ14184 412 aa6.83□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.83□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 STK35Q8TDR2 534 aa6.83□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 USP21Q9UK80 565 aa6.83□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.82□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 GNA15P30679 374 aa6.82□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.82□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 C12orf49Q9H741 205 aa6.82□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.82□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 CTSHP09668 335 aa6.81□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 GSTM4Q03013 218 aa6.81□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 ACAD11Q709F0 780 aa6.81□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 FAM161BQ96MY7 647 aa6.81□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.81□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 PARP2Q9UGN5 583 aa6.81□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 MEGF11A6BM72 1044 aa6.8□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 GIPC1O14908 333 aa6.8□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.8□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.8□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 RASIP1Q5U651 963 aa6.8□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.8□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 PDZD3Q86UT5 571 aa6.8□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.8□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 AK5Q9Y6K8 562 aa6.8□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 ENC1O14682 589 aa6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 PAGE1O75459 146 aa6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 FURINP09958 794 aa6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 MAOBP27338 520 aa6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 DAB2P98082 770 aa6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.79□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 FBXO24O75426 580 aa6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 TIAF1O95411 115 aa6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 USP17L7P0C7H9 530 aa6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 ERCC3P19447 782 aa6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 ATP2B2Q01814 1243 aa6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 TMC4Q7Z404 712 aa6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 SPG7Q9UQ90 795 aa6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.78□□□□□ -1.32
CLVS1-209ENST00000522928 FAM177BA6PVY3 158 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 BMP6P22004 513 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 GSTT1P30711 240 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 ARL4DP49703 201 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 FRMD6Q96NE9 622 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 USP26Q9BXU7 913 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 PREPP48147 710 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF862O60290 1169 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 CELA3AP09093 270 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 DRD2P14416 443 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 POU4F3Q15319 338 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 TP53INP1Q96A56 240 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 RNF208Q9H0X6 261 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 CYP11A1P05108 521 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 GLB1P16278 677 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 DYRK3O43781 588 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 ARNTP27540 789 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 AP3B2Q13367 1082 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 SULF2Q8IWU5 870 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 RGS22Q8NE09 1264 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 GIPC2Q8TF65 315 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 WDR18Q9BV38 432 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 NME2P22392 152 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms