RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 FEZ1Q99689 392 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 JAK2O60674 1132 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 MCAMP43121 646 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ERFEQ4G0M1 354 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 NCOA7Q8NI08 942 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 MTMR7Q9Y216 660 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 USP54Q70EL1 1684 aa9.14□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.13□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 SPATA5Q8NB90 893 aa9.13□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 SPATA32Q96LK8 384 aa9.13□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 E7EWF7 191 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 M0R2C6 588 aa9.13□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 MBD4O95243 580 aa9.13□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 RXRAP19793 462 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CHRNDQ07001 517 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TTC14Q96N46 770 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 DONSONQ9NYP3 566 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.13□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 COL15A1P39059 1388 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM29Q14134 588 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.12□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 MNS1Q8NEH6 495 aa9.12□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF609O15014 1411 aa9.12□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC69A6NI79 296 aa9.11□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 CAMTA2O94983 1202 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ATP2B1P20020 1258 aa9.11□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CAMK4Q16566 473 aa9.11□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 JCADQ9P266 1359 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 B4E1Z4 1266 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 ICE2Q659A1 982 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ME1P48163 572 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 RASGRF1Q13972 1273 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
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