RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 ABCB6Q9NP58 842 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 A0A0A0MRY4 1105 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 METTL12A8MUP2 240 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 H3BRJ5 948 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 EPHA1P21709 976 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 ITPKAP23677 461 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 COL8A1P27658 744 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 KCNMA1Q12791 1236 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.83□□□□□ -0.84
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PDE4D-225ENST00000515835 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 RGS22Q8NE09 1264 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 WNT8BQ93098 351 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 PARP2Q9UGN5 583 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 CD109Q6YHK3 1445 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 LINC01387J3KSC0 135 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.82□□□□□ -0.84
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PDE4D-225ENST00000515835 GIPC2Q8TF65 315 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 C12orf49Q9H741 205 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 SAMD9Q5K651 1589 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 ATP10BO94823 1461 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 PIP4K2BP78356 416 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 SETDB1Q15047 1291 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 FSCN2O14926 492 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 ELNP15502 786 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 GSTT1P30711 240 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 DAB2P98082 770 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 IKBKEQ14164 716 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF576Q9H609 170 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 AK5Q9Y6K8 562 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 TSPOAP1O95153 1857 aa9.79□□□□□ -0.84
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PDE4D-225ENST00000515835 PSMD2Q13200 908 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 TMC4Q7Z404 712 aa9.79□□□□□ -0.84
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PDE4D-225ENST00000515835 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 ARL4DP49703 201 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 PCDH1Q08174 1060 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-225ENST00000515835 BCL11AQ9H165 835 aa9.78□□□□□ -0.84
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PDE4D-225ENST00000515835 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 TM4SF5O14894 197 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 GSK3AP49840 483 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 DCAF5Q96JK2 942 aa9.76□□□□□ -0.85
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PDE4D-225ENST00000515835 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 B3GALT4O96024 378 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 NACC1Q96RE7 527 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 MRS2Q9HD23 443 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-225ENST00000515835 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.75□□□□□ -0.85
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