RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515678.5

ABCE1-210, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 2

Gene ABCE1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-210	ENST00000515678	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	DKK1	O94907	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	ATG7	O95352	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-210	ENST00000515678	KIF4A	O95239	1232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	MAP7	Q14244	749 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	GGN	Q86UU5	652 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	IGHA2	P01877	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	SYN1	P17600	705 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	MYO19	Q96H55	970 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	ALG2	Q9H553	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	IGFBP4	P22692	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	ARL4D	P49703	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	DRD2	P14416	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	KCNA10	Q16322	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	NFKB2	Q00653	900 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	CEP120	Q8N960	986 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-210	ENST00000515678		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	GLI1	P08151	1106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	NFIC	P08651	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	SCNN1A	P37088	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	SEC13	P55735	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	DLGAP3	O95886	979 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	TCF3	P15923	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	ERCC3	P19447	782 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	SUV39H1	O43463	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	CD96	P40200	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	AFM	P43652	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-210	ENST00000515678	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms