RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ALDH1A1P00352 501 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 BCAMP50895 628 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 IFNL1Q8IU54 200 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 FKTNO75072 461 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 TEPSINQ96N21 525 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 EYA2O00167 538 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 FGFR2P21802 821 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 GJA5P36382 358 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 TNNI2P48788 182 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 TEKT1Q969V4 418 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 ELP3Q9H9T3 547 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 CACNB3P54284 484 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 KIF16BQ96L93 1317 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 OPTNQ96CV9 577 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 SLC5A1P13866 664 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 LPIN2Q92539 896 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 MRIQ9BWK5 157 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-211ENST00000513325 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K9P80192 1104 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 PTPN18Q99952 460 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 SIL1Q9H173 461 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 OTOFQ9HC10 1997 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 LAMB1P07942 1786 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 CRHR2Q13324 411 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 MAST3O60307 1309 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 VGLL4Q14135 290 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 TRIM17Q9Y577 477 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 FAM83AQ86UY5 434 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 FBXO3Q9UK99 471 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 CSADQ9Y600 493 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 CIAO1O76071 339 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 ATP2B3Q16720 1220 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.09■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 OTUD5Q96G74 571 aa21.09■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 CCER2I3L3R5 266 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 GTF2A2P52657 109 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 CCL15Q16663 113 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 ERO1AQ96HE7 468 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 MEIS3Q99687 375 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-211ENST00000513325 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.07■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 WRNIP1Q96S55 665 aa21.07■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.07■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.07■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 PRDX5P30044 214 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 SP3Q02447 781 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 HOOK2Q96ED9 719 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 COPRSQ9NQ92 184 aa21.06■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 PHKA1P46020 1223 aa21.05■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.05■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 ERO1BQ86YB8 467 aa21.05■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.05■□□□□ 0.96
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