RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 CDCA5Q96FF9 252 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 CLRN2A0PK11 232 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 RASSF10A6NK89 507 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 MCAMP43121 646 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 GORABQ5T7V8 394 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 CNTNAP1P78357 1384 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 SPATA5Q8NB90 893 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 APBB1O00213 710 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 RAB11FIP3O75154 756 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 JMYQ8N9B5 988 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 TEKT1Q969V4 418 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 PCNTO95613 3336 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 AACSQ86V21 672 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF384Q8TF68 577 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 MYO1BO43795 1136 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 VEGFBP49765 207 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 DCTPP1Q9H773 170 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 SNRKQ9NRH2 765 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 MAST3O60307 1309 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 VEZTQ9HBM0 779 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCF2Q9UG63 623 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-225ENST00000513069 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 RASA3Q14644 834 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 MOB2Q70IA6 237 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ZAP70P43403 619 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CACNB3P54284 484 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 MECOMQ03112 1051 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 GAKO14976 1311 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 HUNKP57058 714 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 TEPSINQ96N21 525 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 CAPNS2Q96L46 248 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 FKBP1BP68106 108 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 FZD1Q9UP38 647 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 BCL11AQ9H165 835 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 USP40Q9NVE5 1235 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa18.58■□□□□ 0.57
SH3BP2-225ENST00000513069 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms