RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 DGKZQ13574 1117 aa28.28■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 TNFAIP1Q13829 316 aa28.28■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 SPRYD7Q5W111 196 aa28.28■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.28■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 UNCXA6NJT0 531 aa28.27■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 SLC5A1P13866 664 aa28.27■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 SIL1Q9H173 461 aa28.27■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 OTOFQ9HC10 1997 aa28.27■■■□□ 2.12
ZBED3-203ENST00000511587 TEPSINQ96N21 525 aa28.26■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 CLMNQ96JQ2 1002 aa28.25■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 MRIQ9BWK5 157 aa28.25■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 COPRSQ9NQ92 184 aa28.25■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.25■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 SREBF2Q12772 1141 aa28.24■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.24■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 TRIM27P14373 513 aa28.23■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 MIER1Q8N108 512 aa28.23■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 TEKT1Q969V4 418 aa28.23■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.23■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.23■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.23■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 ATP2B3Q16720 1220 aa28.22■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 WNK4Q96J92 1243 aa28.22■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.22■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 MAST3O60307 1309 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 BCAR3O75815 825 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 TBC1D8O95759 1140 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 GNAI3P08754 354 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 MTX1Q13505 466 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 TNNQ9UQP3 1299 aa28.21■■■□□ 2.11
ZBED3-203ENST00000511587 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.2■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.2■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 ZBTB22O15209 634 aa28.19■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 TNNI2P48788 182 aa28.19■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.19■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.19■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 GJA5P36382 358 aa28.17■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 CACNB3P54284 484 aa28.17■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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ZBED3-203ENST00000511587 PHKA1P46020 1223 aa28.16■■■□□ 2.1
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ZBED3-203ENST00000511587 IFNL1Q8IU54 200 aa28.15■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.15■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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ZBED3-203ENST00000511587 PRDX5P30044 214 aa28.14■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 ADORA1P30542 326 aa28.14■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 RGS19P49795 217 aa28.14■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
ZBED3-203ENST00000511587 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
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ZBED3-203ENST00000511587 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.13■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.13■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC102BQ68D86 513 aa28.12■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 ELP3Q9H9T3 547 aa28.12■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.12■■■□□ 2.09
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ZBED3-203ENST00000511587 GNAI2P04899 355 aa28.1■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 TIMM10P62072 90 aa28.1■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 MAP3K9P80192 1104 aa28.1■■■□□ 2.09
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ZBED3-203ENST00000511587 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.1■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 A0A1B0GUL7 405 aa28.09■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 TFCP2Q12800 502 aa28.09■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.09■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.08■■■□□ 2.09
ZBED3-203ENST00000511587 RASGRF1Q13972 1273 aa28.08■■■□□ 2.09
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