RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RASA3Q14644 834 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAP3K11Q16584 847 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP2B3Q16720 1220 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAST3O60307 1309 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRPA1O75762 1119 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRKG1Q13976 671 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEKT1Q969V4 418 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRGAP3O43295 1099 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GNAI2P04899 355 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNNI2P48788 182 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AOX1Q06278 1338 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEMA3EO15041 775 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TM4SF4P48230 202 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRIK5Q16478 980 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB22O15209 634 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SREBF2Q12772 1141 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPRYD7Q5W111 196 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABHD8Q96I13 439 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INHBEP58166 350 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEPSINQ96N21 525 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FZD1Q9UP38 647 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNNQ9UQP3 1299 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TIMM10P62072 90 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC102BQ68D86 513 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM83AQ86UY5 434 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HOOK2Q96ED9 719 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ALDH1A1P00352 501 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHKA1P46020 1223 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TFCP2Q12800 502 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1B0GUL7 405 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DGKZQ13574 1117 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WNK4Q96J92 1243 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCOLN1Q9GZU1 580 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADORA1P30542 326 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XAGE2Q96GT9 111 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFHR5Q9BXR6 569 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBC1D8O95759 1140 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRDX5P30044 214 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CACNB3P54284 484 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAP3K9P80192 1104 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP8B2P98198 1209 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RASGRF1Q13972 1273 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLF2Q8IX21 1173 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLA2Q14181 598 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GORABQ5T7V8 394 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IFNL1Q8IU54 200 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SSH3Q8TE77 659 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM151AQ8WW52 585 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms