RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 CEP44Q9C0F1 390 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 CHRDQ9H2X0 955 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 IGFLR1Q9H665 355 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 GREM1O60565 184 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 MMP20O60882 483 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 GPATCH3Q96I76 525 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 BCRP11274 1271 aa3.11□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 J3QW42 95 aa3.11□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 RARAP10276 462 aa3.09□□□□□ -1.91
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