RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, human

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLXNA3-208	ENST00000495040	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRPA1	O75762	1119 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRIM27	P14373	513 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	COPRS	Q9NQ92	184 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	RASA3	Q14644	834 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	GRIK5	Q16478	980 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAP3K11	Q16584	847 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	ATP2B3	Q16720	1220 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	ABHD8	Q96I13	439 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	MRI	Q9BWK5	157 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PLXNA3-208	ENST00000495040	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAST3	O60307	1309 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	TEKT1	Q969V4	418 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	FZD1	Q9UP38	647 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	UNCX	A6NJT0	531 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	MTX1	Q13505	466 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	SRGAP3	O43295	1099 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	TM4SF4	P48230	202 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	TNNI2	P48788	182 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	TNN	Q9UQP3	1299 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	SREBF2	Q12772	1141 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	SPRYD7	Q5W111	196 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PLXNA3-208	ENST00000495040	GNAI2	P04899	355 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	SEMA3E	O15041	775 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	TEPSIN	Q96N21	525 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	DGKZ	Q13574	1117 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZBTB22	O15209	634 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	PHKA1	P46020	1223 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PLXNA3-208	ENST00000495040	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	INHBE	P58166	350 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	WNK4	Q96J92	1243 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADORA1	P30542	326 aa		33	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	CACNB3	P54284	484 aa		33	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCDC102B	Q68D86	513 aa		33	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM83A	Q86UY5	434 aa		33	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		33	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	TBC1D8	O95759	1140 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	TIMM10	P62072	90 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	TFCP2	Q12800	502 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040		A0A1B0GUL7	405 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	LAMB1	P07942	1786 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	OTOF	Q9HC10	1997 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	ALDH1A1	P00352	501 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	PRDX5	P30044	214 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	HOOK2	Q96ED9	719 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	XAGE2	Q96GT9	111 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PLXNA3-208	ENST00000495040	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	32.94	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAP3K9	P80192	1104 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	RASGRF1	Q13972	1273 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	IFNL1	Q8IU54	200 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	ELP3	Q9H9T3	547 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	32.92	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86

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