RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 H0YIN7 160 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 MCAMP43121 646 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 MTFR1LQ9H019 292 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 SLX4Q8IY92 1834 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 MED23Q9ULK4 1368 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 GOLIM4O00461 696 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 FEZ1Q99689 392 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 USP26Q9BXU7 913 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ZAP70P43403 619 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 SCARF1Q14162 830 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 SPATA5Q8NB90 893 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 CNKSR1Q969H4 720 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 HMG20BQ9P0W2 317 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 POLD1P28340 1107 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 GPSM2P81274 684 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 IL17RAQ96F46 866 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 GGA1Q9UJY5 639 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 SNAP23O00161 211 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 BCAMP50895 628 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 RASGRF1Q13972 1273 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 CTR9Q6PD62 1173 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 BANK1Q8NDB2 785 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 CAPN2P17655 700 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ANAPC15P60006 121 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 VPS37DQ86XT2 251 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 LAMA4Q16363 1823 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 PSME4Q14997 1843 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0D9SFI3 127 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 UFL1O94874 794 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 GYG1P46976 350 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE3CQ15386 1083 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 APPBP2Q92624 585 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM227BQ96M60 508 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ADD2P35612 726 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 TGFB2P61812 414 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 MAP3K12Q12852 859 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 WASHC4Q2M389 1173 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 IL25Q9H293 177 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 OGFRQ9NZT2 677 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 SNED1Q8TER0 1413 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 PI16Q6UXB8 463 aa8.52□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 MPNDQ8N594 471 aa8.52□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 EYA3Q99504 573 aa8.52□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.52□□□□□ -1.04
SMARCE1-211ENST00000493660 IL1R1P14778 569 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 KLRK1P26718 216 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPA4P34932 840 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SATB1Q01826 763 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.52□□□□□ -1.05
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