RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 AK5Q9Y6K8 562 aa10.53□□□□□ -0.72
USP34-216ENST00000487547 MEGF11A6BM72 1044 aa10.52□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 NOS3P29474 1203 aa10.52□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 ANKRD24Q8TF21 1146 aa10.52□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 RNF208Q9H0X6 261 aa10.52□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.52□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 ADAM11O75078 769 aa10.51□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 HGSNATQ68CP4 663 aa10.51□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 PARP2Q9UGN5 583 aa10.51□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 PSMD2Q13200 908 aa10.5□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.5□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 CORO1BQ9BR76 489 aa10.5□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.5□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.5□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 USP26Q9BXU7 913 aa10.5□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 DAB2P98082 770 aa10.49□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 POU4F3Q15319 338 aa10.49□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 ANKRD34AQ69YU3 496 aa10.49□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 Q6ZS46 218 aa10.49□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 C3orf58Q8NDZ4 430 aa10.49□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 SAMM50Q9Y512 469 aa10.49□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.48□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 WISP1O95388 367 aa10.48□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 NUTM2GQ5VZR2 741 aa10.48□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 TMC4Q7Z404 712 aa10.48□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 UBASH3BQ8TF42 649 aa10.48□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 CYP4F12Q9HCS2 524 aa10.48□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 ALX3O95076 343 aa10.47□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 USP17L7P0C7H9 530 aa10.47□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 GLB1P16278 677 aa10.47□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 FAAP100Q0VG06 881 aa10.47□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 DOC2BQ14184 412 aa10.47□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 MAOBP27338 520 aa10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 UVSSAQ2YD98 709 aa10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 FDX2Q6P4F2 183 aa10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 SUGCTQ9HAC7 445 aa10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 MRS2Q9HD23 443 aa10.46□□□□□ -0.73
USP34-216ENST00000487547 SART1O43290 800 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 TP53INP1Q96A56 240 aa10.45□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.45□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 SORBS3O60504 671 aa10.44□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10.43□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 H2AFB1P0C5Y9 115 aa10.43□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.43□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 NME2P22392 152 aa10.43□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 SV2BQ7L1I2 683 aa10.43□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.43□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 ITGB7P26010 798 aa10.42□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 ARNTP27540 789 aa10.42□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 TPTE2Q6XPS3 522 aa10.42□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 GIPC2Q8TF65 315 aa10.42□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 RAD18Q9NS91 495 aa10.42□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 SCARA3Q6AZY7 606 aa10.41□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 KRT82Q9NSB4 513 aa10.41□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 LRRC14Q15048 493 aa10.4□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.4□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 SULF2Q8IWU5 870 aa10.4□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 HIF3AQ9Y2N7 669 aa10.4□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
USP34-216ENST00000487547 DHX15O43143 795 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 DLGAP3O95886 979 aa10.39□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 SLFN14P0C7P3 912 aa10.39□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 ST13P50502 369 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 PDE3AQ14432 1141 aa10.39□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 RNF19AQ9NV58 838 aa10.39□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 ENC1O14682 589 aa10.38□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 RLBP1P12271 317 aa10.38□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 CRELD1Q96HD1 420 aa10.38□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.38□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.38□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 CYP8B1Q9UNU6 501 aa10.38□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 TIAF1O95411 115 aa10.37□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 SLC51AQ86UW1 340 aa10.37□□□□□ -0.75
USP34-216ENST00000487547 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.5 ms