RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.8■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 CLRN2A0PK11 232 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 MYO1BO43795 1136 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 VEGFBP49765 207 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 TEKT1Q969V4 418 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 MAST3O60307 1309 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 PRDX5P30044 214 aa25.78■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.78■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.78■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.78■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.76■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.76■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.76■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.76■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.76■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 VEZTQ9HBM0 779 aa25.76■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 MCAMP43121 646 aa25.75■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 PI16Q6UXB8 463 aa25.75■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 SPATA5Q8NB90 893 aa25.75■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 HUNKP57058 714 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 ABCF2Q9UG63 623 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.73■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.73■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.73■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 CRBNQ96SW2 442 aa25.73■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.73■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 APBB1O00213 710 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 RAB11FIP3O75154 756 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 AACSQ86V21 672 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 CAPNS2Q96L46 248 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 FKBP1BP68106 108 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 RASA3Q14644 834 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTB-211ENST00000480301 MOB2Q70IA6 237 aa25.7■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 SNRKQ9NRH2 765 aa25.7■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.7■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.69■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 ECE1P42892 770 aa25.69■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 TNFAIP1Q13829 316 aa25.69■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.69■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 NF2P35240 595 aa25.68■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 CACNB3P54284 484 aa25.68■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 RGMBQ6NW40 437 aa25.68■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 ZNF384Q8TF68 577 aa25.68■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 GRM1Q13255 1194 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 DCTPP1Q9H773 170 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 GAKO14976 1311 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 MECOMQ03112 1051 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 TEPSINQ96N21 525 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 ZAP70P43403 619 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 TNNI2P48788 182 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 PRKG1Q13976 671 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 AOC2O75106 756 aa25.64■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.64■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 SLF2Q8IX21 1173 aa25.64■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 RAI14Q9P0K7 980 aa25.64■■□□□ 1.7
ACTB-211ENST00000480301 FZD1Q9UP38 647 aa25.64■■□□□ 1.7
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