RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM17Q9Y577 477 aa10.79□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 AKAP11Q9UKA4 1901 aa10.79□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 VAMP4O75379 141 aa10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 KCNJ4P48050 445 aa10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 LINS1Q8NG48 757 aa10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 PTPN18Q99952 460 aa10.78□□□□□ -0.68
CTPS1-208ENST00000479480 F6X3S4 739 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 PLIN1O60240 522 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 IL1R1P14778 569 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 INHBEP58166 350 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC27Q2M243 656 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 POTEHQ6S545 545 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 VEZTQ9HBM0 779 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 SSC5DA1L4H1 1573 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 PSME4Q14997 1843 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ALDH1A1P00352 501 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 RASA3Q14644 834 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 BEND3Q5T5X7 828 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 CRHR2Q13324 411 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 GABBR2O75899 941 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 EN2P19622 333 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 GRIK5Q16478 980 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ELP3Q9H9T3 547 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 UNCXA6NJT0 531 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 MYO1BO43795 1136 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 GYG1P46976 350 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 SP3Q02447 781 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 TEPSINQ96N21 525 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 EFCC1Q9HA90 598 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 IL16Q14005 1332 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 FAM205AQ6ZU69 1335 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.73□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 TCP10L2B9ZVM9 353 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 BRI3BPQ8WY22 251 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 OPTNQ96CV9 577 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ERO1AQ96HE7 468 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 KAZALD1Q96I82 304 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 CNNM1Q9NRU3 951 aa10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 GRM8O00222 908 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K9P80192 1104 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 MFSD14BQ5SR56 506 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 ARMC5Q96C12 935 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 SPEF2Q9C093 1822 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CTPS1-208ENST00000479480 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 CRKP46108 304 aa10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 CACNB3P54284 484 aa10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 UBE4AQ14139 1066 aa10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 WDR63Q8IWG1 891 aa10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 SUCLG2Q96I99 432 aa10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.7□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms