RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	COL6A3	P12111	3177 aa		13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.51	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	TNNI2	P48788	182 aa		13.51	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.51	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	CETP	P11597	493 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	MTFR1	Q15390	333 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	DLL1	O00548	723 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	PLIN1	O60240	522 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	FOXO4	P98177	505 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	FLII	Q13045	1269 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	CRK	P46108	304 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	IRF6	O14896	467 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	GJB1	P08034	283 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	PPIL2	Q13356	520 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	HOXD10	P28358	340 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	CTGF	P29279	349 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	GRK4	P32298	578 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	PSMC4	P43686	418 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	GYG1	P46976	350 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	GJA8	P48165	433 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	CCL5	P13501	91 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	OSBP	P22059	807 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279		A0A1W2PPC1	479 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	CACNB3	P54284	484 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	PPAT	Q06203	517 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	GRIK5	Q16478	980 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	UBXN2A	P68543	259 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	PDHX	O00330	501 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
APTX-222	ENST00000478279	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms