RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471978.5

C9orf3-213, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-213ENST00000471978 SLC5A1P13866 664 aa28.15■■■□□ 2.1
C9orf3-213ENST00000471978 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.15■■■□□ 2.1
C9orf3-213ENST00000471978 LPIN2Q92539 896 aa28.15■■■□□ 2.1
C9orf3-213ENST00000471978 CLMNQ96JQ2 1002 aa28.15■■■□□ 2.1
C9orf3-213ENST00000471978 SIL1Q9H173 461 aa28.15■■■□□ 2.1
C9orf3-213ENST00000471978 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.15■■■□□ 2.1
C9orf3-213ENST00000471978 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
C9orf3-213ENST00000471978 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
C9orf3-213ENST00000471978 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
C9orf3-213ENST00000471978 UNCXA6NJT0 531 aa28.13■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.13■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 TEKT1Q969V4 418 aa28.13■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 FBXO3Q9UK99 471 aa28.13■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 WNK4Q96J92 1243 aa28.12■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 CIAO1O76071 339 aa28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 TNNI2P48788 182 aa28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 MEIS3Q99687 375 aa28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 TEPSINQ96N21 525 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 INHBEP58166 350 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 MRIQ9BWK5 157 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 MAST3O60307 1309 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 GPR25O00155 361 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 ATP2B3Q16720 1220 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-213ENST00000471978 ALDH1A1P00352 501 aa28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 RGS19P49795 217 aa28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 CACNB3P54284 484 aa28.06■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 IFNL1Q8IU54 200 aa28.06■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 GNAI3P08754 354 aa28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 COPRSQ9NQ92 184 aa28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 GJA5P36382 358 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 ELP3Q9H9T3 547 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.03■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 FKTNO75072 461 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-213ENST00000471978 OTOFQ9HC10 1997 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 BCAR3O75815 825 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 TRIM27P14373 513 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 FAM83AQ86UY5 434 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 OPTNQ96CV9 577 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 SRGAP3O43295 1099 aa28■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 MAP3K9P80192 1104 aa28■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 LAMB1P07942 1786 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 PHKA1P46020 1223 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 VGLL4Q14135 290 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 TNNQ9UQP3 1299 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 CSADQ9Y600 493 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 SEMA3EO15041 775 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 LDHBP07195 334 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 PRDX5P30044 214 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 ADORA1P30542 326 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 HPS5Q9UPZ3 1129 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 MTX1Q13505 466 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 MIER1Q8N108 512 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 HOOK2Q96ED9 719 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 TIMM10P62072 90 aa27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 CCDC102BQ68D86 513 aa27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 PTPN18Q99952 460 aa27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-213ENST00000471978 GNAI2P04899 355 aa27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-213ENST00000471978 SOX10P56693 466 aa27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-213ENST00000471978 MS4A4AQ96JQ5 239 aa27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-213ENST00000471978 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms