RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 PREPP48147 710 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 FCGRTP55899 365 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 RNF208Q9H0X6 261 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 MAOBP27338 520 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 CEP41Q9BYV8 373 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 B3GALT4O96024 378 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 DRD2P14416 443 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-206ENST00000467748 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 FDX2Q6P4F2 183 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 MEGF11A6BM72 1044 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 COBLO75128 1261 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 POU4F3Q15319 338 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 RNF19AQ9NV58 838 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 RAXQ9Y2V3 346 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 HMX2A2RU54 273 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 BMP3P12645 472 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 MYRFLQ96LU7 910 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 TIAF1O95411 115 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP11A1P05108 521 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 FSTP19883 344 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 SGO2Q562F6 1265 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 STOML1Q9UBI4 398 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 LRP8Q14114 963 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 UVSSAQ2YD98 709 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 STK35Q8TDR2 534 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 CORO1BQ9BR76 489 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXO24O75426 580 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 BEND4Q6ZU67 534 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 FBF1Q8TES7 1133 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-206ENST00000467748 ADH5P11766 374 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 LIG1P18858 919 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 PDE3AQ14432 1141 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 RXRBP28702 533 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 ATP2B2Q01814 1243 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR18Q9BV38 432 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 RAD18Q9NS91 495 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 IGLV1-40P01703 118 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 AP3B2Q13367 1082 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 DYMQ7RTS9 669 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 SHISA5Q8N114 240 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF862O60290 1169 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 AOC2O75106 756 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 PAGE1O75459 146 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-206ENST00000467748 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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