RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 UBE3CQ15386 1083 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ALX1Q15699 326 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 XAGE2Q96GT9 111 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ZMYM6O95789 1325 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SCN7AQ01118 1682 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ZNF213O14771 459 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 RGL2O15211 777 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PDE8AO60658 829 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SCRN1Q12765 414 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 STK3Q13188 491 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MMRN1Q13201 1228 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ITPK1Q13572 414 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ATP2B3Q16720 1220 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 BICD2Q8TD16 824 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TMEM87BQ96K49 555 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 DACT1Q9NYF0 836 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MAST3O60307 1309 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 C4AP0C0L4 1744 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 BCORQ6W2J9 1755 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 POTEFA5A3E0 1075 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 IGSF3O75054 1194 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 YEATS4O95619 227 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 WASHC4Q2M389 1173 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 LRRC24Q50LG9 513 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ADALQ6DHV7 355 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SARM1Q6SZW1 724 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 FERMT3Q86UX7 667 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ANO10Q9NW15 660 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 STK32BQ9NY57 414 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 KINO60870 393 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 GNAT2P19087 354 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 ZNF165P49910 485 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 RCAN1P53805 252 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CTSWP56202 376 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PPP2R5BQ15173 497 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 STX1AQ16623 288 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 METTL24Q5JXM2 366 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 NLRP10Q86W26 655 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TMTC2Q8N394 836 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 JMYQ8N9B5 988 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 LPIN2Q92539 896 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 SOCS7O14512 581 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 CPLX1O14810 134 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 GNPATO15228 680 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 MYO1BO43795 1136 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 PDE8BO95263 885 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 FGAP02671 866 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 TUBB4AP04350 444 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTB-208ENST00000464611 LIG1P18858 919 aa9.92□□□□□ -0.82
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