RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.24■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 AK9Q5TCS8 1911 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 TNFAIP1Q13829 316 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 GRIK5Q16478 980 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 TNNI3KQ59H18 835 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 AIDAQ96BJ3 306 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 ABCF2Q9UG63 623 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 TNNI2P48788 182 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 RASGRF1Q13972 1273 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 BCL11AQ9H165 835 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 GPR108Q9NPR9 543 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 FKBP1BP68106 108 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 APBB1O00213 710 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 PRDX5P30044 214 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 PRKG1Q13976 671 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 RGMBQ6NW40 437 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.17■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 SLF2Q8IX21 1173 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 MRIQ9BWK5 157 aa25.16■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA5Q8NB90 893 aa25.15■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 RASA3Q14644 834 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC102AQ96A19 550 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAF8-204ENST00000461219 AOX1Q06278 1338 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 AACSQ86V21 672 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 AOC2O75106 756 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 MAP2K2P36507 400 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 NOGQ13253 232 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB22O15209 634 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 MOB2Q70IA6 237 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 RAI14Q9P0K7 980 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 RAB11FIP3O75154 756 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 MCAMP43121 646 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 CACNB3P54284 484 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 SNRKQ9NRH2 765 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 PCNTO95613 3336 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 GSTO1P78417 241 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 PI16Q6UXB8 463 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms