RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452811.1

LRRTM1-207, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

TSL 5

Gene LRRTM1, Length 765 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-207ENST00000452811 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 SIL1Q9H173 461 aa22.86■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.86■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 UNCXA6NJT0 531 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 CAPN15O75808 1086 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 RASA3Q14644 834 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 VEZTQ9HBM0 779 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 LAMB1P07942 1786 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 TNNQ9UQP3 1299 aa22.84■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 TM4SF4P48230 202 aa22.83■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 TNFAIP1Q13829 316 aa22.83■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 PRKG1Q13976 671 aa22.83■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 TRPA1O75762 1119 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 ATP2B3Q16720 1220 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 TEKT1Q969V4 418 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 FZD1Q9UP38 647 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 TEPSINQ96N21 525 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 MAST3O60307 1309 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 SRGAP3O43295 1099 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 ABHD8Q96I13 439 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 GNAI2P04899 355 aa22.79■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 SPRYD7Q5W111 196 aa22.79■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.79■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 SEMA3EO15041 775 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 OTOFQ9HC10 1997 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 TNNI2P48788 182 aa22.77■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.77■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.77■■□□□ 1.24
LRRTM1-207ENST00000452811 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 PHKA1P46020 1223 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 SREBF2Q12772 1141 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 FAM83AQ86UY5 434 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 ADORA1P30542 326 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 TIMM10P62072 90 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 CCDC102BQ68D86 513 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 WNK4Q96J92 1243 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 INHBEP58166 350 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 TFCP2Q12800 502 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.73■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 A0A1B0GUL7 405 aa22.73■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 PRDX5P30044 214 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 DGKZQ13574 1117 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 XAGE2Q96GT9 111 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 CACNB3P54284 484 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 POLA2Q14181 598 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRTM1-207ENST00000452811 GJA5P36382 358 aa22.7■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 TBC1D8O95759 1140 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 ALDH1A1P00352 501 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 RLBP1P12271 317 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 MAP3K9P80192 1104 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 ATP8B2P98198 1209 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 RASGRF1Q13972 1273 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-207ENST00000452811 SSH3Q8TE77 659 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms