RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 LBX1P52954 281 aa34.35■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP34.35■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 WDR66Q8TBY9 1149 aa34.34■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 AKAP2Q9Y2D5 859 aa34.34■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 TEKT1Q969V4 418 aa34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 TSKSQ9UJT2 592 aa34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 FZD1Q9UP38 647 aa34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1B0GUL7 405 aa34.32■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 NEUROD6Q96NK8 337 aa34.32■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 SLC10A3P09131 477 aa34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 SPDYE2Q495Y8 402 aa34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC102BQ68D86 513 aa34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 ARMC9Q7Z3E5 817 aa34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 MAST3O60307 1309 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 TCP10L2B9ZVM9 353 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 RASA3Q14644 834 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 RASAL3Q86YV0 1011 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 TNS4Q8IZW8 715 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 XAGE2Q96GT9 111 aa34.29■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 RCAN3Q9UKA8 241 aa34.29■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 DENND2AQ9ULE3 1009 aa34.29■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa34.29■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 ATP8B2P98198 1209 aa34.28■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 TNFAIP1Q13829 316 aa34.28■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 MS4A1P11836 297 aa34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 GORABQ5T7V8 394 aa34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 IFFO2Q5TF58 517 aa34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 PRDM10Q9NQV6 1147 aa34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 POLA2Q14181 598 aa34.26■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa34.26■■■■□ 3.08
FAAP20-210ENST00000440825 SEMA3EO15041 775 aa34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 PRDX5P30044 214 aa34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 CACNB3P54284 484 aa34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 MVPQ14764 893 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 SURF6O75683 361 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 LDHBP07195 334 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 SSH3Q8TE77 659 aa34.24■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 ZDHHC15Q96MV8 337 aa34.24■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 TMOD2Q9NZR1 351 aa34.24■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 SSC5DA1L4H1 1573 aa34.23■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 TNNI2P48788 182 aa34.23■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 RASGRF1Q13972 1273 aa34.23■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 DIXDC1Q155Q3 683 aa34.22■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM39BQ9GZU3 492 aa34.22■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 CA12O43570 354 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 HHIPL2Q6UWX4 724 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 MRIQ9BWK5 157 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 ABCF2Q9UG63 623 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 COG6Q9Y2V7 657 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-210ENST00000440825 CEP85Q6P2H3 762 aa34.19■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 CDAN1Q8IWY9 1227 aa34.19■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 CSRNP1Q96S65 589 aa34.19■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa34.18■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 SALL1Q9NSC2 1324 aa34.18■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 LDLRAD1Q5T700 205 aa34.17■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 IREB2P48200 963 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 SLC10A4Q96EP9 437 aa34.16■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 TRPA1O75762 1119 aa34.15■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 CLMNQ96JQ2 1002 aa34.15■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 TEPSINQ96N21 525 aa34.15■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 TNNI3KQ59H18 835 aa34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 PI16Q6UXB8 463 aa34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 DDX19BQ9UMR2 479 aa34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-210ENST00000440825 USP2O75604 605 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 CAPN15O75808 1086 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 MAP3K11Q16584 847 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 RNF186Q9NXI6 227 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 HMG20BQ9P0W2 317 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA5Q8NB90 893 aa34.12■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 AKAP11Q9UKA4 1901 aa34.12■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 TTC39AQ5SRH9 613 aa34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 DBNDD2Q9BQY9 259 aa34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 GPR108Q9NPR9 543 aa34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 USP40Q9NVE5 1235 aa34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 ERICH6Q7L0X2 663 aa34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms