RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440702.5

FAM20B-202, Transcript of FAM20B, glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

TSL 3

Gene FAM20B, Length 603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20B-202ENST00000440702 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 INHBEP58166 350 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 TRIM17Q9Y577 477 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 ZNF521Q96K83 1311 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.53■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 CACNB3P54284 484 aa21.52■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 CRHR2Q13324 411 aa21.52■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.52■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.52■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 OPTNQ96CV9 577 aa21.52■■□□□ 1.04
FAM20B-202ENST00000440702 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.52■■□□□ 1.04
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FAM20B-202ENST00000440702 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.51■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.51■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.51■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.51■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 TEPSINQ96N21 525 aa21.51■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 BCAMP50895 628 aa21.5■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 PTPN18Q99952 460 aa21.5■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 HTTP42858 3142 aa21.5■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 TNNI2P48788 182 aa21.49■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.49■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.49■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 PTPRCP08575 1304 aa21.49■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 PDE8BO95263 885 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 VGLL4Q14135 290 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 TEKT1Q969V4 418 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 ERO1AQ96HE7 468 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 OTUD5Q96G74 571 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 USP44Q9H0E7 712 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 CSADQ9Y600 493 aa21.47■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 E9PSI1 815 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 MAP3K9P80192 1104 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.46■■□□□ 1.03
FAM20B-202ENST00000440702 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 CCL15Q16663 113 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 AK9Q5TCS8 1911 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 CAP1Q01518 475 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 SP3Q02447 781 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 EFCC1Q9HA90 598 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 FGFR2P21802 821 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.43■■□□□ 1.02
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FAM20B-202ENST00000440702 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.43■■□□□ 1.02
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FAM20B-202ENST00000440702 MAST3O60307 1309 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 SLC5A1P13866 664 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 CENPFP49454 3210 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 GTF2A2P52657 109 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 SLFN5Q08AF3 891 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 SIL1Q9H173 461 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 EYA2O00167 538 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 KIF16BQ96L93 1317 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.4■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FAM20B-202ENST00000440702 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.39■■□□□ 1.01
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FAM20B-202ENST00000440702 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 FAM83AQ86UY5 434 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 LPIN2Q92539 896 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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FAM20B-202ENST00000440702 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 ATP2B3Q16720 1220 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 ERO1BQ86YB8 467 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 BTBD19C9JJ37 291 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 CETPP11597 493 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM20B-202ENST00000440702 DCAF15Q66K64 600 aa21.36■■□□□ 1.01
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