RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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CCDC78-204ENST00000439619 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.4■■□□□ 1.34
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CCDC78-204ENST00000439619 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.39■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 MIER1Q8N108 512 aa23.39■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 MEIS3Q99687 375 aa23.39■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 DGKZQ13574 1117 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 MAP3K11Q16584 847 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 MRIQ9BWK5 157 aa23.38■■□□□ 1.33
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CCDC78-204ENST00000439619 INHBEP58166 350 aa23.36■■□□□ 1.33
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CCDC78-204ENST00000439619 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.35■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 SRGAP3O43295 1099 aa23.35■■□□□ 1.33
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CCDC78-204ENST00000439619 TRIM27P14373 513 aa23.35■■□□□ 1.33
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CCDC78-204ENST00000439619 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.34■■□□□ 1.33
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CCDC78-204ENST00000439619 HOOK2Q96ED9 719 aa23.34■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 AOX1Q06278 1338 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 BCAR3O75815 825 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 GNAI2P04899 355 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 GRIK5Q16478 980 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 FZD1Q9UP38 647 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC78-204ENST00000439619 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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CCDC78-204ENST00000439619 MTX1Q13505 466 aa23.32■■□□□ 1.32
CCDC78-204ENST00000439619 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.32■■□□□ 1.32
CCDC78-204ENST00000439619 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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CCDC78-204ENST00000439619 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.31■■□□□ 1.32
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CCDC78-204ENST00000439619 WNK4Q96J92 1243 aa23.3■■□□□ 1.32
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CCDC78-204ENST00000439619 TEPSINQ96N21 525 aa23.28■■□□□ 1.32
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CCDC78-204ENST00000439619 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.27■■□□□ 1.32
CCDC78-204ENST00000439619 PHKA1P46020 1223 aa23.26■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 CACNB3P54284 484 aa23.26■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 MAP3K9P80192 1104 aa23.26■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
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CCDC78-204ENST00000439619 SLF2Q8IX21 1173 aa23.26■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.26■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1B0GUL7 405 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 GPR25O00155 361 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 ZBTB22O15209 634 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 TIMM10P62072 90 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 TFCP2Q12800 502 aa23.25■■□□□ 1.31
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CCDC78-204ENST00000439619 DCAF15Q66K64 600 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 IFNL1Q8IU54 200 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 ELP3Q9H9T3 547 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 PRDX5P30044 214 aa23.24■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.24■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 OPTNQ96CV9 577 aa23.24■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.24■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 FKTNO75072 461 aa23.23■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 ADORA1P30542 326 aa23.23■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 XAGE2Q96GT9 111 aa23.23■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 TNNQ9UQP3 1299 aa23.23■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.23■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CCDC78-204ENST00000439619 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.23■■□□□ 1.31
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