RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429794.1

CITED1-205, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-205ENST00000429794 TNNI2P48788 182 aa15.6■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.6■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 TEPSINQ96N21 525 aa15.6■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 KIF16BQ96L93 1317 aa15.6■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 PDE8BO95263 885 aa15.59■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 GJA5P36382 358 aa15.59■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 METTL24Q5JXM2 366 aa15.59■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.59■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.59■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 ERO1AQ96HE7 468 aa15.59■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 E9PSI1 815 aa15.58■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 LRRC24Q50LG9 513 aa15.58■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 MRIQ9BWK5 157 aa15.58■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.58■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 TRIM17Q9Y577 477 aa15.58■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 CRHR2Q13324 411 aa15.57■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.57■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 TEKT1Q969V4 418 aa15.57■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 OPTNQ96CV9 577 aa15.57■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 MAST3O60307 1309 aa15.57■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 CENPFP49454 3210 aa15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 PTPN18Q99952 460 aa15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 ELP3Q9H9T3 547 aa15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 MAP3K9P80192 1104 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 VGLL4Q14135 290 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 FAM83AQ86UY5 434 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 HOOK2Q96ED9 719 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 USP44Q9H0E7 712 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 CSADQ9Y600 493 aa15.55■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 FGFR2P21802 821 aa15.54■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 GTF2A2P52657 109 aa15.54■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 SP3Q02447 781 aa15.54■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 GRIK5Q16478 980 aa15.54■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.54■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.54■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.54■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 BCAMP50895 628 aa15.53■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.53■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.53■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 EFCC1Q9HA90 598 aa15.53■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.53■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 EYA2O00167 538 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 SLC5A1P13866 664 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 SLFN5Q08AF3 891 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 ARHGEF6Q15052 776 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 CCL15Q16663 113 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 WDR66Q8TBY9 1149 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 LPIN2Q92539 896 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 ARMC5Q96C12 935 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 FBXO3Q9UK99 471 aa15.52■□□□□ 0.08
CITED1-205ENST00000429794 BRCA2P51587 3418 aa15.52■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 DCAF15Q66K64 600 aa15.51■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 ERO1BQ86YB8 467 aa15.51■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.51■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 OTUD5Q96G74 571 aa15.51■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 AK9Q5TCS8 1911 aa15.51■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 CCER2I3L3R5 266 aa15.5■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 CACNB3P54284 484 aa15.5■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 WRNIP1Q96S55 665 aa15.5■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa15.5■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 ZBTB22O15209 634 aa15.49■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 CIAO1O76071 339 aa15.49■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 CETPP11597 493 aa15.49■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.49■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.49■□□□□ 0.07
CITED1-205ENST00000429794 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms