RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.79□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 USP26Q9BXU7 913 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 ADAMTS12P58397 1594 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 FBLN1P23142 703 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 SBNO1A3KN83 1393 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 SV2BQ7L1I2 683 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 RPS6KB1P23443 525 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 TNNC1P63316 161 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 VWA3BQ502W6 1294 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 DEXIO95424 95 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 TUBB2AQ13885 445 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 EYA1Q99502 592 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-205ENST00000419504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.77□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 MAST3O60307 1309 aa14.77□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.77□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 PTGS1P23219 599 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 FBF1Q8TES7 1133 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 MYL5Q02045 173 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 TICAM2Q86XR7 235 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 TCHPQ9BT92 498 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 RGS22Q8NE09 1264 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 GCP02774 474 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 CCDC14Q49A88 953 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 TSPYL6Q8N831 410 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 VEZTQ9HBM0 779 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 POLD1P28340 1107 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 JDP2Q8WYK2 163 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 KIFAP3Q92845 792 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 EYA2O00167 538 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 MBD4O95243 580 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 PPP2R5BQ15173 497 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 IFNKQ9P0W0 207 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 PLXNC1O60486 1568 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 TIGD1Q96MW7 591 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 TNNI3KQ59H18 835 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 VAV2P52735 878 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 TESK2Q96S53 571 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 MSL1Q68DK7 614 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 INSRP06213 1382 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 MXRA7P84157 204 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 PLS1Q14651 629 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 SMC6Q96SB8 1091 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 132.5
TNS1-205ENST00000419504 C8orf37Q96NL8 207 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 PDE8AO60658 829 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-205ENST00000419504 ATP5DP30049 168 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms