RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 VEGFBP49765 207 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 GRIK5Q16478 980 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 TEKT1Q969V4 418 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.11■■□□□ 1.13
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SEMA3B-201ENST00000416295 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 MRIQ9BWK5 157 aa22.11■■□□□ 1.13
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SEMA3B-201ENST00000416295 CST9Q5W186 159 aa22.1■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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SEMA3B-201ENST00000416295 AAMPQ13685 434 aa22.09■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 AACSQ86V21 672 aa22.09■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SPATA5Q8NB90 893 aa22.09■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 AIDAQ96BJ3 306 aa22.09■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.09■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.09■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.09■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 APBB1O00213 710 aa22.08■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.08■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.08■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.08■■□□□ 1.13
SEMA3B-201ENST00000416295 ECE1P42892 770 aa22.07■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 MCAMP43121 646 aa22.07■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 CDCA5Q96FF9 252 aa22.07■■□□□ 1.12
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SEMA3B-201ENST00000416295 ABCF2Q9UG63 623 aa22.07■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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SEMA3B-201ENST00000416295 CLRN2A0PK11 232 aa22.06■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.06■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 DLK2Q6UY11 383 aa22.06■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 TNS4Q8IZW8 715 aa22.06■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 VEZTQ9HBM0 779 aa22.06■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.06■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 TNFAIP1Q13829 316 aa22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 PI16Q6UXB8 463 aa22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 SLF2Q8IX21 1173 aa22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.05■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.04■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.04■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.04■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.04■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 DCTPP1Q9H773 170 aa22.04■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 NF2P35240 595 aa22.03■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.03■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.03■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 WBP1LQ9NX94 342 aa22.03■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.03■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 AOX1Q06278 1338 aa22.03■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 FOXN1O15353 648 aa22.02■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.02■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 CAPNS2Q96L46 248 aa22.02■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.02■■□□□ 1.12
SEMA3B-201ENST00000416295 TNNI2P48788 182 aa22.01■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 FKBP1BP68106 108 aa22.01■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.01■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 SNRKQ9NRH2 765 aa22.01■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.01■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.01■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 IGSF3O75054 1194 aa22■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 GSTO1P78417 241 aa22■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 MECOMQ03112 1051 aa22■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 RASA3Q14644 834 aa22■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 BCL11AQ9H165 835 aa22■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 RAI14Q9P0K7 980 aa22■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 GAKO14976 1311 aa22■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 ZAP70P43403 619 aa21.99■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 HUNKP57058 714 aa21.99■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.99■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.98■■□□□ 1.11
SEMA3B-201ENST00000416295 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.98■■□□□ 1.11
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