RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 SHISA4Q96DD7 197 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 CSADQ9Y600 493 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 KIF22Q14807 665 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 MTFR1Q15390 333 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 LINS1Q8NG48 757 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 DPF3Q92784 378 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 BTBD19C9JJ37 291 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 FLIIQ13045 1269 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 CEP290O15078 2479 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 TNNI2P48788 182 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 CTGFP29279 349 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 CRKP46108 304 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 CETPP11597 493 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 GYG1P46976 350 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 PRMT2P55345 433 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 GRIK5Q16478 980 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 IRF6O14896 467 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 GNRH1P01148 92 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 CACNB3P54284 484 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf99Q6UX52 265 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 ERO1BQ86YB8 467 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 DLL1O00548 723 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 PRO3102Q9H379 93 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 CPA4Q9UI42 421 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 SNAPC2Q13487 334 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 WRNIP1Q96S55 665 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 SRRDQ9UH36 339 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD12-201ENST00000404162 PSMC4P43686 418 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 UBE4AQ14139 1066 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM47Q96LD4 638 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 OSBPP22059 807 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 GJA8P48165 433 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 PPIL2Q13356 520 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 F6X3S4 739 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 GRK4P32298 578 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 BEND3Q5T5X7 828 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 GJB1P08034 283 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 CCL5P13501 91 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 RAET1EQ8TD07 263 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 HOXD10P28358 340 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 RNF208Q9H0X6 261 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD12-201ENST00000404162 MYPNQ86TC9 1320 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 PDHXO00330 501 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 INPP5BP32019 993 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 PPATQ06203 517 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 FAM83AQ86UY5 434 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 WWC1Q8IX03 1113 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 TEKT1Q969V4 418 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 CACNA1FO60840 1977 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 GRM8O00222 908 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 VAMP4O75379 141 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC27Q2M243 656 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms