RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM39BQ9GZU3 492 aa16.8■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 CRKP46108 304 aa16.79■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 CRHR2Q13324 411 aa16.79■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.79■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.79■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.79■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 MYO1BO43795 1136 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 CACNB3P54284 484 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 USP44Q9H0E7 712 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 ELP3Q9H9T3 547 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 BCAMP50895 628 aa16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 UNCXA6NJT0 531 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 ALDH1A1P00352 501 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 FGFR2P21802 821 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 IREB2P48200 963 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 INHBEP58166 350 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 OPTNQ96CV9 577 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM17Q9Y577 477 aa16.76■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 POTEFA5A3E0 1075 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 PDE8BO95263 885 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 VGLL4Q14135 290 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 METTL24Q5JXM2 366 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.75■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.73■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 PTPRCP08575 1304 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 SLFN5Q08AF3 891 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 TNFAIP1Q13829 316 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 MAP3K9P80192 1104 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.71■□□□□ 0.27
CNGA3-202ENST00000393503 VPS37DQ86XT2 251 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 OTUD5Q96G74 571 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 E9PSI1 815 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 EYA2O00167 538 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 SP3Q02447 781 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 CCL15Q16663 113 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 TEKT1Q969V4 418 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 ARMC5Q96C12 935 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 KIF16BQ96L93 1317 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 ERO1AQ96HE7 468 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 MRIQ9BWK5 157 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 EFCC1Q9HA90 598 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 IRF6O14896 467 aa16.67■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 NFIAQ12857 509 aa16.67■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.67■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 FAM83AQ86UY5 434 aa16.67■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 WRNIP1Q96S55 665 aa16.67■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.67■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 BTBD19C9JJ37 291 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 PRDX5P30044 214 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 INPP5BP32019 993 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 TNNI2P48788 182 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 GTF2A2P52657 109 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 SIL1Q9H173 461 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 CTGFP29279 349 aa16.65■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 MOGSQ13724 837 aa16.65■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.65■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.65■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 LPIN2Q92539 896 aa16.65■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF333Q96JL9 665 aa16.65■□□□□ 0.26
CNGA3-202ENST00000393503 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms