RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 EPAS1Q99814 870 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 TONSLQ96HA7 1378 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 FRMD3A2A2Y4 597 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 MCM5P33992 734 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 IL17RAQ96F46 866 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-202ENST00000380828 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 DEUP1Q05D60 604 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 KCTD2Q14681 263 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-202ENST00000380828 M0R2C6 588 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-202ENST00000380828 GALNT17Q6IS24 598 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-202ENST00000380828 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM37O94972 964 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPHP41219 470 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 BHMTQ93088 406 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 E2F6O75461 281 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 GNAT2P19087 354 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 PAK2Q13177 524 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.85□□□□□ -1.15
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RABGEF1-202ENST00000380828 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 ITIH3Q06033 890 aa7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC80Q76M96 950 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 SMARCE1Q969G3 411 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM22Q9Y584 194 aa7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRKAR2BP31323 418 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 HDAC4P56524 1084 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 GBP6Q6ZN66 633 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-202ENST00000380828 KAT2BQ92831 832 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 GTF3C6Q969F1 213 aa7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-202ENST00000380828 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0B4J203 849 aa7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-202ENST00000380828 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf74Q96LT6 269 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 CAVIN2O95810 425 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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