RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MPNDQ8N594 471 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MTA3Q9BTC8 594 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 NAPBQ9H115 298 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 E7EWF7 191 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MBD4O95243 580 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 BAG3O95817 575 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 IL1R1P14778 569 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 PLCG2P16885 1265 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 PDCP20941 246 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MCM5P33992 734 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 GPSM2P81274 684 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 NFKBIBQ15653 356 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 KRT23Q9C075 422 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 COA1Q9GZY4 146 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 TAF1P21675 1872 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.12□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 G3V3G9 751 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 C6orf229H3BNL8 230 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 TDO2P48775 406 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 TMEM87BQ96K49 555 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 CD209Q9NNX6 404 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SOGA3Q5TF21 947 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 Q6ZUG5 572 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 TMTC2Q8N394 836 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ARMT1Q9H993 441 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 COL4A1P02462 1669 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 EP400Q96L91 3159 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ERICH2A1L162 156 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 CHGBP05060 677 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 POLD1P28340 1107 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MCM4P33991 863 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 PPP4CP60510 307 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MECOMQ03112 1051 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 NBR1Q14596 966 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MSL1Q68DK7 614 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 PODNQ7Z5L7 613 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 LCORLQ8N3X6 602 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 RGS22Q8NE09 1264 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 VPS33BQ9H267 617 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.09□□□□□ -1.11
KCNQ1-204ENST00000380776 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms