RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379915.4

AC009690.1-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AC009690.1, Length 4,374 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009690.1-201ENST00000379915 CCDC122Q5T0U0 273 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 RAD50Q92878 1312 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 ETF1P62495 437 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 MYL5Q02045 173 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 ALG1Q9BT22 464 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 TTC6Q86TZ1 520 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 CEP131Q9UPN4 1083 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.11■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 FAM170AA1A519 330 aa16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.172e-7■■■□□ 17.3
AC009690.1-201ENST00000379915 VPS16Q9H269 839 aa16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 E2F5Q15329 346 aa16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 MYD88Q99836 296 aa16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 CLCN6P51797 869 aa16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 MSH6P52701 1360 aa16.1■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 KIF5AQ12840 1032 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 ERCC3P19447 782 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 EPC1Q9H2F5 836 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 SAMM50Q9Y512 469 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 PTPRCP08575 1304 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 VAV2P52735 878 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 LGR6Q9HBX8 967 aa16.09■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 TUBB4AP04350 444 aa16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 RUFY3Q7L099 469 aa16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 CABS1Q96KC9 395 aa16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.08■□□□□ 0.17
AC009690.1-201ENST00000379915 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 ZMYND10O75800 440 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 USP5P45974 858 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 SLC39A6Q13433 755 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 WASF1Q92558 559 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 TRIM66O15016 1216 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 KSR1Q8IVT5 923 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 NAPBQ9H115 298 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 CEP83Q9Y592 693 aa16.08■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 ATP7BP35670 1465 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 MYOM1P52179 1685 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 KRT86O43790 486 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 ATP8B2P98198 1209 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 CCDC42Q96M95 316 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 PPLO60437 1756 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 PCK1P35558 622 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 GNGT1P63211 74 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 SLF1Q9BQI6 1058 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.07■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 UBXN1Q04323 297 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 PLIN2Q99541 437 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 TACC1O75410 805 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 MYZAPP0CAP1 466 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 NBPF6Q5VWK0 638 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 NBPF4Q96M43 638 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.06■□□□□ 0.16
AC009690.1-201ENST00000379915 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms