RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375850.3

C9orf47-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene C9orf47, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-202ENST00000375850 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
C9orf47-202ENST00000375850 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
C9orf47-202ENST00000375850 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.14■■■□□ 2.26
C9orf47-202ENST00000375850 MRIQ9BWK5 157 aa29.14■■■□□ 2.26
C9orf47-202ENST00000375850 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.14■■■□□ 2.26
C9orf47-202ENST00000375850 ERO1AQ96HE7 468 aa29.13■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 LAMB1P07942 1786 aa29.12■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.12■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 TEKT1Q969V4 418 aa29.12■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 TEPSINQ96N21 525 aa29.12■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 MAST3O60307 1309 aa29.12■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.11■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 LRRC24Q50LG9 513 aa29.11■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 HOOK2Q96ED9 719 aa29.11■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 TRIM17Q9Y577 477 aa29.11■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 OPTNQ96CV9 577 aa29.1■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.1■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 GJA5P36382 358 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 MAP3K9P80192 1104 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 USP44Q9H0E7 712 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 ELP3Q9H9T3 547 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 CSADQ9Y600 493 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 CRHR2Q13324 411 aa29.08■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.08■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.08■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.08■■■□□ 2.25
C9orf47-202ENST00000375850 GTF2A2P52657 109 aa29.07■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 FAM83AQ86UY5 434 aa29.07■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.07■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 ARHGEF6Q15052 776 aa29.06■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 MS4A4AQ96JQ5 239 aa29.06■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 FGFR2P21802 821 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 SP3Q02447 781 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 PTPN18Q99952 460 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 FBXO3Q9UK99 471 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 EYA2O00167 538 aa29.04■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 BCAMP50895 628 aa29.04■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 SLFN5Q08AF3 891 aa29.04■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 VGLL4Q14135 290 aa29.04■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 HHIPL2Q6UWX4 724 aa29.04■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 LPIN2Q92539 896 aa29.04■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 SLC5A1P13866 664 aa29.03■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 GRIK5Q16478 980 aa29.03■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.03■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 EFCC1Q9HA90 598 aa29.03■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.03■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.03■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.02■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa29.02■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
C9orf47-202ENST00000375850 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa29.01■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 SPDYE5A6NIY4 337 aa29.01■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 CCL15Q16663 113 aa29.01■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.01■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.01■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 DCAF15Q66K64 600 aa29■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 ERO1BQ86YB8 467 aa29■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 BRI3BPQ8WY22 251 aa29■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.99■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 ARMC5Q96C12 935 aa28.98■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 OTUD5Q96G74 571 aa28.98■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 OTOFQ9HC10 1997 aa28.98■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 CIAO1O76071 339 aa28.97■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 CETPP11597 493 aa28.97■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 WRNIP1Q96S55 665 aa28.97■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 CACNB3P54284 484 aa28.96■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.96■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 PCDH10Q9P2E7 1040 aa28.96■■■□□ 2.23
C9orf47-202ENST00000375850 SNAPC2Q13487 334 aa28.95■■■□□ 2.22
C9orf47-202ENST00000375850 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.95■■■□□ 2.22
C9orf47-202ENST00000375850 ZBTB22O15209 634 aa28.94■■■□□ 2.22
C9orf47-202ENST00000375850 PPIL2Q13356 520 aa28.94■■■□□ 2.22
C9orf47-202ENST00000375850 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.94■■■□□ 2.22
C9orf47-202ENST00000375850 ZNF341Q9BYN7 854 aa28.94■■■□□ 2.22
C9orf47-202ENST00000375850 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.94■■■□□ 2.22
C9orf47-202ENST00000375850 SEMA3EO15041 775 aa28.93■■■□□ 2.22
C9orf47-202ENST00000375850 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
C9orf47-202ENST00000375850 FAM151AQ8WW52 585 aa28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms