RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372090.5

TOE1-201, Transcript of target of EGR1, exonuclease, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOE1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOE1-201	ENST00000372090	ARHGAP6	O43182	974 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	NCAPH	Q15003	741 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	FAM228A	Q86W67	206 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	FBXW7	Q969H0	707 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	PSMD2	Q13200	908 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	CDC23	Q9UJX2	597 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	HMMR	O75330	724 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	ZNF202	O95125	648 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	SHTN1	A0MZ66	631 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	RAB27A	P51159	221 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	SLC8A3	P57103	927 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	FANCC	Q00597	558 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	REST	Q13127	1097 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	MTA1	Q13330	715 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090		A0A1W2PP64	1363 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	TUBB4B	P68371	445 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	PPFIA1	Q13136	1202 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	NAA25	Q14CX7	972 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	DPF2	Q92785	391 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	AGPS	O00116	658 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	ARMC3	Q5W041	872 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	WDR93	Q6P2C0	686 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	PDHB	P11177	359 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	VCPKMT	Q9H867	229 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	TUBB	P07437	444 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	TRIM74	Q86UV6	250 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	TRIM73	Q86UV7	250 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	CEP57	Q86XR8	500 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	SPDL1	Q96EA4	605 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOE1-201	ENST00000372090	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	ATP1A3	P13637	1013 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	GGCX	P38435	758 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	KCNB1	Q14721	858 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	C3orf20	Q8ND61	904 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PRPH	P41219	470 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	ARHGAP25	P42331	645 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	GNGT1	P63211	74 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	VSTM4	Q8IW00	320 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	SAAL1	Q96ER3	474 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	SH3GL2	Q99962	352 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	CDK19	Q9BWU1	502 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	KIAA0754	O94854	1291 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOE1-201	ENST00000372090	PEX19	P40855	299 aa		15.19	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms