RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 WDR62O43379 1518 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 BMP15O95972 392 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 A0A1B0GVL5 298 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 UBXN1Q04323 297 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 PDE8AO60658 829 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 SKILP12757 684 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 NEMFO60524 1076 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 USH1GQ495M9 461 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 ERCC3P19447 782 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 SYT1P21579 422 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CALML3P27482 149 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 ACTN2P35609 894 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 DNAI1Q9UI46 699 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 GINS2Q9Y248 185 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 TBX22Q9Y458 520 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 SBNO1A3KN83 1393 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 TTC6Q86TZ1 520 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 PICK1Q9NRD5 415 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.071e-8■■■□□ 16
PTPRK-207ENST00000368226 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 KCNQ3O43525 872 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 MCM3P25205 808 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 SLC27A2O14975 620 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 GNA11P29992 359 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 GPAA1O43292 621 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 ATP2C2O75185 946 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 TYRO3Q06418 890 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 TRAF1Q13077 416 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CPXCR1Q8N123 301 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 USP26Q9BXU7 913 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 FSD2A1L4K1 749 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 H0YIN7 160 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC172P0C7W6 258 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 USP37Q86T82 979 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 SLAIN2Q9P270 581 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 ZAP70P43403 619 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRK-207ENST00000368226 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 SORBS3O60504 671 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 INCENPQ9NQS7 918 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 RPS6KB1P23443 525 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PARP10Q53GL7 1025 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 PHKBQ93100 1093 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 IFNKQ9P0W0 207 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC169A6NNP5 214 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRK-207ENST00000368226 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 27.7
PTPRK-207ENST00000368226 TXKP42681 527 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms