RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 TEPSINQ96N21 525 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.39■■□□□ 1.34
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UBE2C-204ENST00000356455 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
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UBE2C-204ENST00000356455 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 A0A1B0GUL6 1792 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 TLR2O60603 784 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 CETPP11597 493 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
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UBE2C-204ENST00000356455 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
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UBE2C-204ENST00000356455 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 GNRH1P01148 92 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 GYG1P46976 350 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 PRMT2P55345 433 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 BTBD19C9JJ37 291 aa23.34■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 SNAPC2Q13487 334 aa23.34■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.33■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 CEP290O15078 2479 aa23.33■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 ERO1BQ86YB8 467 aa23.33■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 WRNIP1Q96S55 665 aa23.33■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.33■■□□□ 1.33
UBE2C-204ENST00000356455 CACNB3P54284 484 aa23.32■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 UBE4AQ14139 1066 aa23.32■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 MTFR1Q15390 333 aa23.32■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.31■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 IRF6O14896 467 aa23.31■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.31■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 SHISA4Q96DD7 197 aa23.31■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.31■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 F6X3S4 739 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 VPS37DQ86XT2 251 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 RAET1EQ8TD07 263 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 CPA4Q9UI42 421 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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UBE2C-204ENST00000356455 HOOK2Q96ED9 719 aa23.29■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.29■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 SRRDQ9UH36 339 aa23.29■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 GRIK5Q16478 980 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 BEND3Q5T5X7 828 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 WWC1Q8IX03 1113 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 TEKT1Q969V4 418 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 GRM8O00222 908 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 GRK4P32298 578 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 C17orf99Q6UX52 265 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 TRIM47Q96LD4 638 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
UBE2C-204ENST00000356455 OSBPP22059 807 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC27Q2M243 656 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 DCAF15Q66K64 600 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 CCL5P13501 91 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 CTGFP29279 349 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 PPATQ06203 517 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 RNF208Q9H0X6 261 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 MYPNQ86TC9 1320 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 SZT2Q5T011 3432 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 PDHXO00330 501 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 DLL1O00548 723 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 GJA8P48165 433 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 UBXN2AP68543 259 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 FAM83AQ86UY5 434 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 IL16Q14005 1332 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 GJB1P08034 283 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2C-204ENST00000356455 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.23■■□□□ 1.31
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