RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 E9PCH4 1651 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PSMA7O14818 248 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SURF6O75683 361 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF165P49910 485 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TTC22Q5TAA0 569 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FYB2Q5VWT5 728 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 HVCN1Q96D96 273 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 DRC3Q9H069 523 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MIS12Q9H081 205 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NYXQ9GZU5 481 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP6O43182 974 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CIB2O75838 187 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ADCY5O95622 1261 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 GALNT17Q6IS24 598 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RAB17Q9H0T7 212 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FLT4P35916 1363 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 HSPA6P17066 643 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 KIF5AQ12840 1032 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 LGSNQ5TDP6 509 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NME9Q86XW9 330 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TMTC1Q8IUR5 882 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTS8Q9UP79 889 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ATP7AQ04656 1500 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PPFIA2O75334 1257 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PLCG2P16885 1265 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TDO2P48775 406 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NECTIN2Q92692 538 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC68Q9H2F9 335 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 A2ML1A8K2U0 1454 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NLRP1Q9C000 1473 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FIBPO43427 364 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RFC4P35249 363 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 HSPA2P54652 639 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RETREG2Q8NC44 543 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 FAM71BQ8TC56 605 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-201ENST00000355233 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MYH6P13533 1939 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-201ENST00000355233 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MAP3K12Q12852 859 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 UGGT1Q9NYU2 1555 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ZMYND15Q9H091 742 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 PPCSQ9HAB8 311 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF365Q70YC5 407 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 AFAP1L1Q8TED9 768 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 C8orf37Q96NL8 207 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 EYA3Q99504 573 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 CUEDC2Q9H467 287 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 EFCAB8A8MWE9 144 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF131P52739 623 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D31Q96DN5 1066 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MLH3Q9UHC1 1453 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RGS12O14924 1447 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 KDM4AO75164 1064 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 SLC5A1P13866 664 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 AKAP4Q5JQC9 854 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
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