RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 KLHDC4Q8TBB5 520 aa31.47■■■□□ 2.63
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PPP4R4-202ENST00000328839 TCP10L2B9ZVM9 353 aa31.46■■■□□ 2.63
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO33Q7Z6M2 555 aa31.46■■■□□ 2.63
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PPP4R4-202ENST00000328839 ELP3Q9H9T3 547 aa31.44■■■□□ 2.62
PPP4R4-202ENST00000328839 TNNI2P48788 182 aa31.43■■■□□ 2.62
PPP4R4-202ENST00000328839 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa31.43■■■□□ 2.62
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PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM39BQ9GZU3 492 aa31.42■■■□□ 2.62
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PPP4R4-202ENST00000328839 TEPSINQ96N21 525 aa31.4■■■□□ 2.62
PPP4R4-202ENST00000328839 SLFN5Q08AF3 891 aa31.39■■■□□ 2.62
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM17Q9Y577 477 aa31.39■■■□□ 2.62
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PPP4R4-202ENST00000328839 ALDH1L2Q3SY69 923 aa31.35■■■□□ 2.61
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PPP4R4-202ENST00000328839 MAST3O60307 1309 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC34A2O95436 690 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4R4-202ENST00000328839 VGLL4Q14135 290 aa31.34■■■□□ 2.61
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PPP4R4-202ENST00000328839 OTOP1Q7RTM1 612 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4R4-202ENST00000328839 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4R4-202ENST00000328839 ERO1AQ96HE7 468 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPN18Q99952 460 aa31.34■■■□□ 2.61
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PPP4R4-202ENST00000328839 SLC5A1P13866 664 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP3K9P80192 1104 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP4R4-202ENST00000328839 CD99L2Q8TCZ2 262 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF16BQ96L93 1317 aa31.32■■■□□ 2.6
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PPP4R4-202ENST00000328839 ZDHHC15Q96MV8 337 aa31.32■■■□□ 2.6
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PPP4R4-202ENST00000328839 GTF2A2P52657 109 aa31.28■■■□□ 2.6
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PPP4R4-202ENST00000328839 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa31.24■■■□□ 2.59
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PPP4R4-202ENST00000328839 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP4R4-202ENST00000328839 HTTP42858 3142 aa31.22■■■□□ 2.59
PPP4R4-202ENST00000328839 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PPP4R4-202ENST00000328839 DCAF15Q66K64 600 aa31.22■■■□□ 2.59
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PPP4R4-202ENST00000328839 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
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PPP4R4-202ENST00000328839 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
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PPP4R4-202ENST00000328839 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
PPP4R4-202ENST00000328839 DIXDC1Q155Q3 683 aa31.2■■■□□ 2.59
PPP4R4-202ENST00000328839 MIGA2Q7L4E1 593 aa31.2■■■□□ 2.59
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO3Q9UK99 471 aa31.2■■■□□ 2.59
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