RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.62■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.62■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 ECE2O60344 883 aa23.61■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.61■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 ANAPC15P60006 121 aa23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF384Q8TF68 577 aa23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 AIDAQ96BJ3 306 aa23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 SCN9AQ15858 1988 aa23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 KIF2CQ99661 725 aa23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 PSME4Q14997 1843 aa23.59■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 GSTO1P78417 241 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 NECTIN1Q15223 517 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 VPS53Q5VIR6 699 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 IL17RAQ96F46 866 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC71-201ENST00000321895 MBD4O95243 580 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 KCNB2Q92953 911 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 FBXW7Q969H0 707 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 GRIK5Q16478 980 aa23.56■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 RNF20Q5VTR2 975 aa23.56■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 PALD1Q9ULE6 856 aa23.56■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 FOXP2O15409 715 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 GNAT2P19087 354 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 ARMT1Q9H993 441 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 USP17L3A6NCW0 530 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 USP17L4A6NCW7 530 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 NFKBIEO00221 500 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 LDHCP07864 332 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 RABEP1Q15276 862 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 SLF2Q8IX21 1173 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 LCORLQ8N3X6 602 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 CERS5Q8N5B7 392 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 COL4A5P29400 1685 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 SLC27A2O14975 620 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 DACT2Q5SW24 774 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 SYT17Q9BSW7 474 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 YDJCA8MPS7 323 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 NIM1KQ8IY84 436 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 ZMYM6O95789 1325 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 RASEFQ8IZ41 740 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCDC71-201ENST00000321895 ALX1Q15699 326 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 CERS3Q8IU89 383 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 FGAP02671 866 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 APPP05067 770 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 MXD3Q9BW11 206 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 LAMA4Q16363 1823 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 GAKO14976 1311 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 BAG3O95817 575 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 PPP4CP60510 307 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 IL27Q8NEV9 243 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 JDP2Q8WYK2 163 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 CYP21A2P08686 494 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 PRKAB2O43741 272 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 KRT32Q14532 448 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC71-201ENST00000321895 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms